Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms