Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN15O75808 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN15O75808 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN15O75808 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms