Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP10AO60312 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP10AO60312 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms