Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms