Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRTM2O43300 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms