Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms