Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD8O14715 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD8O14715 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms