Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2O14595 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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