Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms