Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms