Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms