Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DGG1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DGG1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DGG1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DGG1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms