Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms