Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM223BA6NKX1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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