Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms