Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC144AA2RUR9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms