Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms