Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms