Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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