Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHF24Q9UPV7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHF24Q9UPV7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms