Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CEP164Q9UPV0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP164Q9UPV0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CEP164Q9UPV0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms