Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms