Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms