Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms