Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXO9Q9UK97 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms