Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNL1Q9UK58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms