Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms