Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSR3Q9UJK0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSR3Q9UJK0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms