Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms