Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms