Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms