Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms