Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms