Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPJQ9HC77 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms