Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3GQ9HC16 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms