Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRAGCQ9HB90 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRAGCQ9HB90 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms