Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms