Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D6

FHDC1, FH2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHDC1Q9C0D6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FHDC1Q9C0D6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms