Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms