Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms