Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARXQ96QS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms