Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms