Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms