Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL4Q96JN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL4Q96JN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms