Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED3Q96IU2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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