Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4DQ8WXI8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms