Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms