Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF3Q8TEJ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms