Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF398Q8TD17 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF398Q8TD17 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms