Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00301Q8NCQ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00301Q8NCQ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms